El jurado está presidido por Jürg Stenzl, profesor de Musicología de la Universidad de Salzburgo (Austria), y cuenta como secretario con Siegfried Mauser, rector de la Universidad de Música y Artes Escénicas de Múnich (Alemania).
El resto de miembros del jurado son Hugues Dufourt, compositor y director emérito de investigación en el Centre National de Recherche Scientifique (CNRS), en Francia; Ranko Markovic, director artístico del Conservatorio de la Universidad de Viena (Austria); Luis de Pablo, compositor español, y Dieter Torkewitz, catedrático de Teoría de la Música en la Universidad de Música y Artes Escénicas de Viena (Austria).
La deliberación de cada uno de los jurados tiene lugar a puerta cerrada en la sede de la Fundación BBVA (Madrid) durante un único día, el anterior al anuncio.
Los nominados en la edición de 2009, en el conjunto de sus categorías (Cambio Climático; Tecnologías de la Información y la Comunicación; Ciencias Básicas; Biomedicina; Ecología y Biología de la Conservación; Cooperación al Desarrollo; Música Contemporánea, y Economía, Finanzas y Gestión de Empresas) proceden de una treintena de países y han sido presentados por las principales instituciones académicas y organismos de investigación en todo el mundo.
Cada categoría está dotada con 400.000 euros.